Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF1CO43896 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF1CO43896 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF1CO43896 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIF1CO43896 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms