Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3IP2O43734 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP2O43734 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP2O43734 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3IP2O43734 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms