Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
HTATSF1O43719 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
HTATSF1O43719 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HTATSF1O43719 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HTATSF1O43719 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HTATSF1O43719 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HTATSF1O43719 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms