Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP2AO43633 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMP2AO43633 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMP2AO43633 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP2AO43633 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHMP2AO43633 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP2AO43633 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP2AO43633 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms