Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCXO43602 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCXO43602 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCXO43602 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCXO43602 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCXO43602 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCXO43602 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCXO43602 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCXO43602 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCXO43602 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DCXO43602 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCXO43602 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCXO43602 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCXO43602 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCXO43602 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCXO43602 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCXO43602 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCXO43602 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCXO43602 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCXO43602 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCXO43602 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCXO43602 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCXO43602 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCXO43602 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCXO43602 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCXO43602 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCXO43602 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCXO43602 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCXO43602 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCXO43602 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCXO43602 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCXO43602 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCXO43602 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCXO43602 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCXO43602 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCXO43602 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DCXO43602 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DCXO43602 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCXO43602 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCXO43602 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DCXO43602 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCXO43602 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCXO43602 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCXO43602 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCXO43602 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCXO43602 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCXO43602 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCXO43602 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DCXO43602 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCXO43602 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCXO43602 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCXO43602 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCXO43602 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCXO43602 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCXO43602 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCXO43602 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DCXO43602 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCXO43602 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCXO43602 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCXO43602 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCXO43602 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCXO43602 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCXO43602 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCXO43602 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCXO43602 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DCXO43602 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DCXO43602 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCXO43602 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCXO43602 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCXO43602 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCXO43602 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCXO43602 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCXO43602 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCXO43602 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms