Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LATO43561 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LATO43561 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LATO43561 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LATO43561 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LATO43561 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LATO43561 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LATO43561 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LATO43561 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LATO43561 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LATO43561 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LATO43561 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LATO43561 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LATO43561 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LATO43561 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LATO43561 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LATO43561 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LATO43561 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LATO43561 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LATO43561 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LATO43561 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LATO43561 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LATO43561 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LATO43561 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LATO43561 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LATO43561 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LATO43561 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LATO43561 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LATO43561 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LATO43561 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LATO43561 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LATO43561 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LATO43561 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LATO43561 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LATO43561 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LATO43561 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LATO43561 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LATO43561 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LATO43561 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LATO43561 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LATO43561 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LATO43561 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LATO43561 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LATO43561 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LATO43561 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LATO43561 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LATO43561 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LATO43561 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LATO43561 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LATO43561 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LATO43561 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LATO43561 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LATO43561 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LATO43561 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LATO43561 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LATO43561 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LATO43561 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LATO43561 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LATO43561 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LATO43561 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LATO43561 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LATO43561 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LATO43561 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LATO43561 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LATO43561 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LATO43561 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LATO43561 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LATO43561 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LATO43561 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LATO43561 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LATO43561 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LATO43561 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LATO43561 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LATO43561 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LATO43561 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LATO43561 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LATO43561 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LATO43561 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LATO43561 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LATO43561 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LATO43561 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LATO43561 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LATO43561 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LATO43561 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LATO43561 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LATO43561 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LATO43561 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LATO43561 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms