Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1GO43497 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1GO43497 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1GO43497 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms