Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF749O43361 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF749O43361 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF749O43361 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF749O43361 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF749O43361 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms