Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRXO43186 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRXO43186 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRXO43186 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRXO43186 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRXO43186 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRXO43186 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRXO43186 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRXO43186 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRXO43186 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRXO43186 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRXO43186 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRXO43186 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRXO43186 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRXO43186 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRXO43186 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRXO43186 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRXO43186 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRXO43186 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRXO43186 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRXO43186 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRXO43186 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRXO43186 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRXO43186 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRXO43186 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRXO43186 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRXO43186 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRXO43186 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRXO43186 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRXO43186 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRXO43186 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRXO43186 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRXO43186 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRXO43186 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRXO43186 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRXO43186 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRXO43186 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRXO43186 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRXO43186 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRXO43186 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRXO43186 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRXO43186 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRXO43186 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRXO43186 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRXO43186 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRXO43186 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRXO43186 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRXO43186 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRXO43186 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRXO43186 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRXO43186 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRXO43186 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRXO43186 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRXO43186 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRXO43186 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRXO43186 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRXO43186 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRXO43186 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRXO43186 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRXO43186 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRXO43186 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRXO43186 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRXO43186 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRXO43186 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms