Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YKT6O15498 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YKT6O15498 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YKT6O15498 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YKT6O15498 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YKT6O15498 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YKT6O15498 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YKT6O15498 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YKT6O15498 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YKT6O15498 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YKT6O15498 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YKT6O15498 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YKT6O15498 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YKT6O15498 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YKT6O15498 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YKT6O15498 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YKT6O15498 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YKT6O15498 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YKT6O15498 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YKT6O15498 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YKT6O15498 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YKT6O15498 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YKT6O15498 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YKT6O15498 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YKT6O15498 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YKT6O15498 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YKT6O15498 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YKT6O15498 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YKT6O15498 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YKT6O15498 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YKT6O15498 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YKT6O15498 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YKT6O15498 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YKT6O15498 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YKT6O15498 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YKT6O15498 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YKT6O15498 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YKT6O15498 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
YKT6O15498 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YKT6O15498 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YKT6O15498 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
YKT6O15498 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YKT6O15498 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YKT6O15498 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YKT6O15498 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
YKT6O15498 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YKT6O15498 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YKT6O15498 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YKT6O15498 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YKT6O15498 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
YKT6O15498 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YKT6O15498 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YKT6O15498 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YKT6O15498 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YKT6O15498 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YKT6O15498 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YKT6O15498 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YKT6O15498 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YKT6O15498 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YKT6O15498 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YKT6O15498 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YKT6O15498 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YKT6O15498 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YKT6O15498 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YKT6O15498 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YKT6O15498 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YKT6O15498 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YKT6O15498 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YKT6O15498 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
YKT6O15498 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YKT6O15498 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YKT6O15498 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YKT6O15498 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YKT6O15498 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YKT6O15498 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YKT6O15498 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YKT6O15498 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms