Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC9O14530 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC9O14530 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC9O14530 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms