Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA4O00629 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA4O00629 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms