Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
I3L4J1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
I3L4J1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
I3L4J1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
I3L4J1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
I3L4J1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
I3L4J1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
I3L4J1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
I3L4J1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
I3L4J1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
I3L4J1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
I3L4J1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
I3L4J1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
I3L4J1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
I3L4J1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
I3L4J1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
I3L4J1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
I3L4J1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
I3L4J1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
I3L4J1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
I3L4J1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
I3L4J1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
I3L4J1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
I3L4J1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
I3L4J1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
I3L4J1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
I3L4J1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
I3L4J1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
I3L4J1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
I3L4J1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
I3L4J1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
I3L4J1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
I3L4J1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
I3L4J1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
I3L4J1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
I3L4J1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
I3L4J1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
I3L4J1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
I3L4J1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
I3L4J1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
I3L4J1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
I3L4J1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
I3L4J1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
I3L4J1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
I3L4J1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
I3L4J1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
I3L4J1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
I3L4J1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
I3L4J1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
I3L4J1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
I3L4J1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
I3L4J1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
I3L4J1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
I3L4J1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
I3L4J1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
I3L4J1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
I3L4J1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
I3L4J1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
I3L4J1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
I3L4J1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
I3L4J1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
I3L4J1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
I3L4J1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
I3L4J1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
I3L4J1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
I3L4J1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
I3L4J1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
I3L4J1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
I3L4J1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
I3L4J1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
I3L4J1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
I3L4J1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
I3L4J1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
I3L4J1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
I3L4J1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms