Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABARAPH6UMI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPH6UMI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPH6UMI1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms