Protein–RNA interactions for Protein: H3BS89

TMEM178B, Transmembrane protein 178B, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM178BH3BS89 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM178BH3BS89 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM178BH3BS89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM178BH3BS89 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms