Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms