Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4E171 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4E171 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4E171 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4E171 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4E171 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4E171 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4E171 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4E171 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4E171 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B4E171 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4E171 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B4E171 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
B4E171 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4E171 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4E171 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4E171 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4E171 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4E171 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4E171 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4E171 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4E171 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4E171 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B4E171 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4E171 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B4E171 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
B4E171 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4E171 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4E171 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4E171 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
B4E171 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4E171 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4E171 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4E171 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4E171 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4E171 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4E171 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4E171 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4E171 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
B4E171 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4E171 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4E171 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4E171 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4E171 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4E171 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4E171 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4E171 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4E171 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4E171 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4E171 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4E171 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4E171 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4E171 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4E171 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
B4E171 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4E171 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4E171 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4E171 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4E171 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4E171 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4E171 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4E171 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4E171 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4E171 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4E171 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4E171 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
B4E171 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4E171 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4E171 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4E171 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4E171 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4E171 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4E171 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4E171 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4E171 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4E171 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4E171 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
B4E171 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4E171 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B4E171 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
B4E171 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms