Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM114B3SHH9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM114B3SHH9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM114B3SHH9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms