Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPB2A8KAH6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPB2A8KAH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPB2A8KAH6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms