Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.58■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms