Protein–RNA interactions for Protein: A6NMZ7

COL6A6, Collagen alpha-6(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 2,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A6A6NMZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL6A6A6NMZ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL6A6A6NMZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A6A6NMZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms