Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGPD3A6NKT7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGPD3A6NKT7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD3A6NKT7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms