Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC69A6NI79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC69A6NI79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC69A6NI79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms