Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC154A6NI56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC154A6NI56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC154A6NI56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms