Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM221AA4D161 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM221AA4D161 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM221AA4D161 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms