Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA8A3KMH1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA8A3KMH1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA8A3KMH1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWA8A3KMH1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms