Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC66A2RUB6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC66A2RUB6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms