Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBC2A0A5B9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC2A0A5B9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC2A0A5B9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
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