Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQC6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1W2PQC6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1W2PQC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1W2PQC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1W2PQC6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1W2PQC6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1W2PQC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A1W2PQC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A1W2PQC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms