Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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