Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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