Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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