Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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MKRN4PQ13434 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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