Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms