Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP1Q9Y3L3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP1Q9Y3L3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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