Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZDHHC9Q9Y397 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC9Q9Y397 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms