Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM2AQ9Y2K7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms