Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF6Q9Y252 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms