Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FZD1Q9UP38 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms