Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80Q9ULG1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms