Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms