Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXL4Q9UKA2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms