Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACFD1Q9UGQ2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms