Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT172Q9UG01 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms