Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms