Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPF2Q9P2E5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms