Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCAL1Q9NZC9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCAL1Q9NZC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms