Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8A2Q9NTI2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8A2Q9NTI2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms