Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDREJQ9NTG1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDREJQ9NTG1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms