Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms